Die Haushaltskommission des Fachbereichs berät den Fachbereichsrat in Finanzfragen, meistens geht es um die grundsätzliche Verteilung von Geldern und andere grundsätzliche Probleme. So wurde 2006 in dieser Kommission ein neues Verteilungsmodell ausgearbeitet, welches die Verteilung des von der Universität zugewiesenen Geldes an die Institute des Fachbereiches regelt. Dieses neue Modell berücksichtigt beispielsweise aktuellere Studierendenzahlen als das zuvor eingesetzte Modell. Die Haushaltskommission tagt somit bei aktuellen Problemen, etwa einmal pro Semester.
Mitglieder sind 8 Professoren (Gruppe 1, darunter Dekan und Prodekan), 2 Studierende (Gruppe 2) und 5 wissenschaftliche Mitarbeiter (Gruppe 3).
Ferner existiert eine Haushaltskomission der Physikinstitute. Hier geht es speziell um den Etat, den die Physikinstitute zur Verfügung haben.